Музей истории «Лефортово» был создан в 1999 году постановлением Правительства Москвы. Открытие состоялось 25 сентября – в трехсотлетнюю годовщину Лефортова. Заведение является филиалом Музея истории Москвы.
Экспозиция, посвященная одному району, стала первой в своем роде. Период, охватываемый выставками музея, начинается с петровской эпохи и заканчивается настоящим временем. Среди экспонатов множество документов Российского архива древних актов, Военного архива, предметов Государственного исторического музея и частных коллекций.
Некоторые материалы предоставлены ведущими предприятиями и госпиталями Лефортова. На экскурсиях по каждому временному промежутку развития района проводится обзор с демонстрацией фотографий, бытовых предметов, продукции местных промышленных объектов, карт просторов Лефортова. Посетителям обязательно поведают о пребывании на этих территориях Екатерины I , Елизаветы Петровны, Екатерины II, Павла и Петра II.
Большинство рассказов ведется в форме театрализовано-костюмированных представлений.