От м. «Маяковская» Замоскворецкой линии посетители дойдут до НИИ нейрохирургии им. Н.Н. Бурденко примерно за 5 минут, следуя по 1-му Тверскому-Ямскому переулку, затем на 2-м перекрестке повернув налево, на 4-ю Тверскую-Ямскую улицу и пройдя до здания организации. Также пешком можно добраться сюда от метро «Новослободская» Кольцевой линии (время пути составит не более 11 минут). От м. «Менделевская» Серпуховско-Тимирязевской линии посетители доедут до медицинского учреждения на троллейбусах №3, №3к, №47, выйдя на остановке «Оружейный переулок» (далее пешком по 4-й Тверской-Ямской улице). Для того чтобы добраться сюда на авто, необходимо, двигаясь по внешней стороне Садового кольца, осуществить съезд на Оружейный переулок, затем, свернув на улицу 4-я Тверская-Ямская, проехать по ней до здания учреждения примерно 350 метров.