От м. «Щукинская» Таганско-Краснопресненской линии посетители доедут до Научно-клинического центра оториноларингологии ФМБА на автобусах №100, №681 или маршрутке №100, выйдя на остановке «86-я клиническая больница» (3-я остановка). Также недалеко от учреждения находится метро «Сокол» Замоскворецкой линии, от которой можно добраться до него на автобусе или маршрутном такси №100, следуя до той же остановки. Для того чтобы добраться до организации на автомобиле, необходимо, двигаясь по проспекту Маршала Жукова, осуществить съезд на Живописную улицу, далее примерно через 3 км (не доезжая до перекрестка с Новощукинской улицей) повернуть направо, на улицу Академика Бочвара, затем на 1-м перекрестке свернуть еще раз направо, на улицу Гамалеи, и проехать по ней примерно 500 метров.