История музея гигиены Центра медицинской профилактики начинается еще с 1877 года, когда состоялась гигиеническая выставка в Брюсселе, в которой принимала участие и Россия. Некоторые российские экспонаты получили признание на этой выставке, благодаря чему в России также были организованы гигиенические выставки. Последняя выставка прошла в 1913 году, а ее экспонаты стали первым материалом для музея, который был открыт в 1919 году.
Основными целями музея являются предоставление обществу информации об истории развития гигиены и медицины, о важнейших медицинских достижениях, об анатомических и физиологических особенностях строения человека, а также пропаганда здорового образа жизни. С этой целью в музее содержатся материалы санитарно-гигиенической и медицинской тематики, которые представлены в виде макетов, схем, плакатов.
Музей оснащен технологическим оборудованием, позволяющим доносить информацию посетителям наиболее эффектно и красочно. Помимо физиологических особенностей человека, а также медицинских достижений, в музее представлены материалы об экологической ситуации в мире. Кроме экскурсионной деятельности музей организует выездные выставки.