Пешком удобнее всего добираться до Храма Святителя Николая в Кленниках от станции московского метрополитена «Китай-Город» (выход к улице Маросейка), так как церковь располагается в самом начале Маросейки, рядом с выходом из метро. Также в пешей доступности от храма расположена станция метро «Лубянка» Сокольнической линии, от которой посетители дойдут до него за 5 минут, двигаясь по Лубянскому проезду, а затем свернув на Маросейку. Посетители на личном транспорте легко найдут Храм Николая Святителя в районе станции метро «Китай-Город», на пересечении улицы Маросейка с Лубянским проездом.